Müzenin raylı ulaşım kısmı iki bölümden oluşmaktadır. Aralarında Sultan Abdülaziz’in Saltanat Vagonu ve Kadıköy-Moda Tramvayı’nın da yer aldığı demir yolu araçları, ince işçilikli lokomotif ve tramvay modellerinin yanı sıra, demir yolları ile ilgili çeşitli fotoğraflar ve efemeralar sergilenmektedir.